H. margaritaceus trưởng thành đạt kích thước khoảng 13 cm. Cá đực trưởng thành có màu xanh lục với nhiều đốm màu đỏ cam nối lại thành những vệt sọc. Đầu cũng có nhiều vệt sọc màu đỏ hồng. Con đực đang lớn có một mảng đen lớn ở bên thân. Các vây tiệp màu với thân; đuôi có nhiều sọc đỏ. Cá mái có màu vàng lục. Lưng có nhiều đốm trắng. Bụng trắng với một dải màu hồng giữa vây bụng và vây hậu môn. Có 3 đốm đen: đốm lớn giữa vây lưng, đốm nhỏ hơn sau mắt và đốm khác trên mang[3][4][5].

Số gai ở vây lưng: 9; Số tia vây mềm ở vây lưng: 11; Số gai ở vây hậu môn: 3; Số tia vây mềm ở vây hậu môn: 11; Số tia vây mềm ở vây ngực: 13[3].

Thức ăn của H. margaritaceus là các loài động vật không xương sống nhỏ, cá nhỏ và cả trứng cá[1][2].